Apa itu HyperChem?
HyperChem
ialah suatu program simulasi dan pemodelan molekular yang memung-kinkan
perhitungan kimiawi yang kompleks. HyperChem mencakup fungsi-fungsi berikut:
1.
Membuat sketsa dwimatra (2D) molekul dari atom-atom penyusunnya,
lalu mengubahnya menjadi model trimatra (3D) dengan HyperChem Model Builder.
2.
Memilih residu-residu standar secara berurutan dari
perpustakaan asam amino dan nukleotida HyperChem/Lite untuk membangun protein
dan asam nukleat.
3.
Membaca tipe atom dan koordinat molekular yang telah
disimpan sebagai arsip HIN (masukan HyperChem yang dibuat sebelumnya) atau
arsip ENT (mengambil dari sumber lain, yaitu Brookhaven Protein Data Bank/PDB)
4.
Menata kembali molekul, misalnya dengan memutar atau
menggesernya.
5.
Mengubah kondisi tampilan, termasuk penampakan ruang,
model molekul, dan label struktural.
6.
Merancang dan melakukan perhitungan kimiawi, termasuk
dinamika molekular.
Tersedia berbagai metode
mekanika molekular maupun mekanika kuantum (semiempiris atau ab initio). Perhitungan mekanika molekular
menggunakan medan gaya MM+, AM-BER, BIO+, atau OPLS, sedangkan mekanika kuantum
semiempiris meliputi extended Hückel, CNDO, INDO, MINDO3, MNDO, AM1,
PM3, ZINDO/I, dan ZINDO/S.
7.
Penetapan efek isotop dalam perhitungan analisis
vibrasional untuk metode-metode SCF ab initio dan semiempiris.
8.
Membuat grafik Excel dari hasil perhitungan kimiawi.
9.
Mensolvasikan molekul dalam kotak periodik.
Manfaat HyperChem :
HyperChem dapat digunakan untuk menentukan beberapa sifat struktur antara lain :
· Stabilitas relatif dari
beberapa isomer
· Panas pembentukan
· Energi aktivasi
· Muatan atom
· Beda energi HOMO-LUMO
· Potensial Ionisasi
· Afinitas elektron
· Momen dipol
· Tingkat energi elektronik
· Energi korelasi electron
MP2
· Energi keadaan
tereksitasi CI
· Sifat dan struktur
keadaan transisi
· Energi interaksi
non-bonded
· Spektra serapan UV-VIS
· Spektra Absorpsi IR
· Pengaruh isotop pada
vibrasi
· Spektra serapan IR
· Efek Collision pada sifat
struktur
· Stabilitas dari kluster
Simulasi
· Interaksi Docking
· Pengaruh temperatur pda gerakan molekul
· Pengaruh pelarut pda struktur dan dinamika
· Interaksi intermolekular pada kluster
Sumber : http://chittaputri.blogspot.com/2011/12/manfaat-hypechem.html
Tidak ada komentar:
Posting Komentar